滤波器的选用，根据应用场合、目的及要求等不同，选用的原则大致如下：
1.工作条件：电流I， 电压V，工作温度T和体积尺寸
额定电流 额定电流对应额定工作温度，超过额定工作温度的需降额。低于额定工作温度的，工作电流以额定电流为准。
额定电压 一般情况下，交流滤波器可用作同等电压的直流滤波器， 如果用于更高的DC电压，需咨询厂家。对滤波器而言，标称的额定电压为器件允许的最大工作电压，如UL60939描述：
其它特殊要求
例如医疗专用的低漏电流、高等级绝缘要求、IT电网的适用、高脉冲电压、过长的输出电缆等等。此要求非常重要，直接关系到电源滤波器是否适用。如果随意选取，轻则可能导致失效，也可能导致安全事故。
安装位置及要求 电源滤波器大部分用于电源的输入端，一般要求滤波器的安装板为金属平板(无绝缘层覆盖且防氧化)，且最好大面积接地。如无相应条件，要尽可能减少接地线的阻抗，减少接地电阻。
2.使用要求：
a.常规应用
常规使用于滤除一般干扰，增加系统的抗干扰能力，对当前干扰情况及目标要求不是很明确。此类应用大部分设备或系统内部的控制板、开关电源或功能器件等。此时一般选用常规中等功能的就行。行业有个3dB的说法，就是如果滤波器衰减干扰达到3dB，则干扰的能量仅为原来的一半。一般来讲，电源滤波器在其工作频段的衰减能力都有数十dB，所以对常规来讲，干扰能量经过衰减后已经比较小了，对系列的影响也相应变小，可靠性得到较好保障。
b.有明确标准
用于家用电器、机械设备、电机控制器等应用的滤波器，需配合设备通过相应标准。这些应用有明确的要求及标准，电磁干扰值(传导干扰)必须限定在某一标准范围之内。此时，应尽可能提供信息给滤波器生产厂家，厂家会根据应用情况选择类似应用的产品供初步测试(条件允许的条件下，可以多提供几种类型)，再根据现场测试情况做调整。如变频器的开关频率、整流方式、电机工作频率、电缆类型及长度，有无输出滤波等等。
c.功能要求
除了EMI的相关标准要求，还有些功能性要求。例如用于变频器输出的滤波器，需保护电机绝缘、电缆绝缘，减少轴承电流等等。此时，对不同的要求，应对方案及产品也有较大的差异。
其它：滤波器的阶数
在很大部分人的印象中，滤波器的阶数(此处仅指共模电感数量)越多越好。但事实上，不同电源滤波器对不同频率的衰减是不同的。举例来说，某EUT需在5M~6M频率衰减60dB。对某一单阶滤波器，其衰减频率刚好是在4M~8M，70dB。一般来讲，对于同样体积的双阶滤波器，其电感值(和、或电容值)一般小于单阶中的一个电感的电感值。双阶滤波器会有两个衰减振荡点，假设在在同样体积下，某双阶滤波器振荡点分别在1M~4M和10M~15M，衰减为55dB。此时，如果选用双阶滤波器，完美的错过了EUT本身的干扰频率，此时，单阶滤波器的肯定比所说的双阶滤波器好。当然，也有可能EUT的干扰频率刚好落在双阶滤波器的干扰振荡频率上，此时就是双阶滤波器比单阶的好。
也就是说，单阶或双阶滤波器不存在谁好谁不好的问题(基于可对比的前提下)，适合的才是最好的。
同理，对于滤波器内的磁芯材料，也不存在非晶、纳米晶的就一定比锰锌的好，因为每种材料所对应的干扰频段是不一样的，EUT本身的干扰频率和所选滤波器的干扰抑制频段相匹配才是最好的。